Chaque année, l’association choisit un directeur artistique extérieur (responsable d’institution, artiste, commissaire indépendant…) qui donne à chaque cycle de résidence de nouvelles orientations et fonde ainsi la singularité du projet artistique des Ateliers des Arques. L’expérimentation et la recherche constituent le cœur du projet de la résidence organisée tous les printemps durant trois mois, et donne naissance, tous les étés, à une exposition collective à ciel ouvert qui questionne ce territoire si particulier, ouvre l’espace public au dialogue et actualise les problématiques inhérentes à la ruralité.
À partir de 2024, l'association ouvre une seconde période de résidence essentiellement axée sur de la recherche. Il s'agit d'un programme d'un mois en Septembre dédié aux artistes originaires de / ou résident en Occitanie et pratiquant le dessin.
Depuis 2015, en partenariat avec Les Abattoirs – Frac Occitanie / Toulouse et l'Artothèque du Lot, Les Ateliers des Arques mettent en œuvre un projet d'exposition qui poursuit le double objectif de diffuser les collections publiques et d'assurer une présence continue de l'art contemporain sur le territoire de la Communauté de Communes Cazals-Salviac. L'exposition se déploie dans les quatre médiathèques de la Communauté de Communes : Cazals, Frayssinet-le-Gélat, Rampoux et Salviac chaque année de mi-octobre à mi-décembre.